MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010487	ATTT	3	12	1	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010487	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010487	TTG	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010487	TA	3	6	40	45	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010487	TGATAT	2	12	66	77	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170650758
6	NC_010487	TTTCTT	2	12	88	99	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	170650758
7	NC_010487	A	7	7	103	109	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
8	NC_010487	TAT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
9	NC_010487	TTTG	2	8	123	130	0 %	75 %	25 %	0 %	170650758
10	NC_010487	ATC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650758
11	NC_010487	AAACAA	2	12	171	182	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170650758
12	NC_010487	AATA	2	8	183	190	75 %	25 %	0 %	0 %	170650758
13	NC_010487	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
14	NC_010487	CAAT	2	8	277	284	50 %	25 %	0 %	25 %	170650758
15	NC_010487	A	8	8	333	340	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
16	NC_010487	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
17	NC_010487	TGA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
18	NC_010487	AAC	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650758
19	NC_010487	TA	3	6	481	486	50 %	50 %	0 %	0 %	170650758
20	NC_010487	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
21	NC_010487	A	7	7	545	551	100 %	0 %	0 %	0 %	170650758
22	NC_010487	ATG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
23	NC_010487	ATA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650758
24	NC_010487	TTA	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
25	NC_010487	TAA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010487	CAGT	2	8	815	822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010487	GCA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010487	T	6	6	929	934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010487	AC	3	6	940	945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010487	CTGA	2	8	970	977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010487	TGA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010487	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010487	TGA	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010487	ACA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010487	GTG	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010487	GAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010487	TAA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010487	CTA	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010487	TA	3	6	1505	1510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010487	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010487	T	8	8	1539	1546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010487	ATA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010487	GAGT	2	8	1604	1611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010487	CAT	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010487	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650759
46	NC_010487	ACC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650759
47	NC_010487	GCAT	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	170650759
48	NC_010487	G	6	6	1927	1932	0 %	0 %	100 %	0 %	170650759
49	NC_010487	ATG	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
50	NC_010487	ATG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
51	NC_010487	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650759
52	NC_010487	T	7	7	2178	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	170650759
53	NC_010487	ATT	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010487	ATAA	2	8	2298	2305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010487	A	6	6	2304	2309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010487	A	6	6	2311	2316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010487	TAA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010487	CTG	2	6	2431	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010487	GC	3	6	2446	2451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010487	GATCCA	2	12	2514	2525	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010487	AGA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010487	TGT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010487	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650757
64	NC_010487	TAACG	2	10	2726	2735	40 %	20 %	20 %	20 %	170650757
65	NC_010487	CCG	2	6	2780	2785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650757
66	NC_010487	C	6	6	2808	2813	0 %	0 %	0 %	100 %	170650757
67	NC_010487	GTG	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010487	C	6	6	3038	3043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_010487	CTG	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010487	GCA	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010487	CGGAG	2	10	3147	3156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010487	ACC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010487	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010487	AAG	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010487	AAC	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010487	TC	3	6	3407	3412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010487	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010487	CAAA	2	8	3436	3443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010487	ATA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010487	T	6	6	3492	3497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010487	TCA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.